Isomorphic Labsの次世代IsoDDEエンジンが、複雑でターゲットが難しい分子のAI駆動設計を進化させる

概要

IsoDDEは、予測精度の向上、ターゲット範囲の拡大、複雑な生物学的システム向けの新しい化学物質の創出を可能にする次世代AIプラットフォームとして提案されています。

Isomorphic Labs Unveils IsoDDE: The Most Advanced AI Platform For In Silico Drug Design

Google DeepMindのスピンオフ企業であるIsomorphic Labsは、2026年2月時点で最も先進的な公開された計算薬物設計用AIシステムとされるIsoDDEを発表しました。

このプラットフォームは、AlphaFold 3の構造予測にとどまらず、デジタル薬物開発の長年の課題を解決するためのフルサイクルのインシリコエンジンとして位置付けられています。

同社によると、IsoDDEは未知の生物学的システムに一般化し、従来の物理シミュレーションに頼らずに結合親和性を予測し、隠れた調節ポケットを特定し、抗体やその他の複雑な生体分子と効果的に機能するよう設計されています。

内部プログラムでは、Isomorphic LabsはIsoDDEが既存の構造を解釈したり、実験的に注釈されていなかったポケットを検出したり、薬物化が難しいと考えられるターゲットに対して新しい化学物質を生成したりするのに既に使用されていると報告しています。このシステムは、構造予測と実用的な薬物設計タスクの橋渡しを目的とした統合された計算フレームワークとして提示されており、従来の深層学習や物理ベースのアプローチを超える精度を提供すると同社は主張しています。

このプラットフォームの開発は、2024年のAlphaFold 3リリース以降のAIを活用した分子モデリングの急速な進展に続いています。あのモデルはタンパク質とリガンドの構造予測を大きく進歩させましたが、実世界の薬物発見パイプラインに計算手法を適用する課題、すなわち多様な生化学的性質を扱い、訓練データ外のシステムに外挿することは完全には解決していません。IsoDDEは、このギャップを埋めるためのスケーラブルな基盤を提供し、生物学的・化学的空間の未踏領域をナビゲートできることを目指しています。

Isomorphic Labsは、IsoDDEがすでに大手製薬企業とのコラボレーションに組み込まれており、プラットフォームはインシリコ設計と予測を行い、パートナーは実験的検証と臨床開発を進めていると述べています。同社は内部パイプラインの拡大も継続しており、2025年から2026年にかけて、2025年3月の6億ドルを超える資金調達を含む大規模な投資を獲得し、主に腫瘍学分野の独自分子を臨床試験に進める準備を進めています。

IsoDDEは、予測精度の向上、薬可能なターゲットの範囲拡大、分子モデリングから実験的に検証された治療候補への移行を加速させる次世代の計算エンジンとして提案されています。

IsoDDEはAI駆動型薬物設計の新たな基準を打ち立てる

IsoDDEは、予測精度と機能範囲の大幅な進歩として説明されており、人間の生物学を支配する分子システムの詳細な理解を提供し、それらに作用する化合物の計算設計を改善しています。

Isomorphic Labsの進行中の研究プログラムでは、同プラットフォームが未解明の構造の解釈や、実験的に特定されていなかったポケットの検出、難治性の治療ターゲットに向けた新しい化学物質の生成に日常的に使用されていると報告されています。

同社は、これらの強化された能力を薬物発見の難しい分野に適用し、インシリコ薬物設計の境界を拡大し続ける計画を示しています。

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